У чым розніца паміж матывам і даменам у бялку?


адказ 1:

Дзякуй за A2A,

але я думаю, што Амея Дравід правільна адказала на ваша пытанне.

У асноўным, бялковы матыў - гэта суперардынатная структура, якая складаецца з альфа-спіралі і / або бэта-ліста і выпадковай шпулькі. Гэта не абавязкова мае біялагічную функцыю.

Аднак бялковыя дамены трохмерна структураваны на / у бялку, які можа ўзаемадзейнічаць з іншымі бялкамі / макрамалекул / малекуламі і мае некаторыя біялагічныя функцыі. Напрыклад, транскрыпцыйныя фактары (TF) - гэта група бялкоў, якія маюць "дамены, якія звязваюць ДНК". TFs сядзяць перад / падчас сінтэзу РНК з ДНК на прамоторным або ўзмацняльным сегменце ДНК, выкарыстоўваючы свой звязваючы дамен ДНК. Некаторыя ТФ маюць дамен, які звязвае іх з галоўнай канаўкай ДНК, іншыя - з малой канаўкай.

Рэдагаваць 1:

Матывы не з'яўляюцца незалежна ўстойлівымі (не ўстойлівыя за межамі бялку). Матывы могуць быць часткай даменаў.

Дамены стабільныя незалежна адзін ад аднаго.

Рэдагаваць 2:

Калі матыў можа мець біялагічную функцыю, яго можна назваць даменам. Прыклад: Матывы пальцаў цынку звязаны са звязваннем ДНК, таму іх таксама называюць даменамі цынкавага пальца.

Усе гэтыя сродкі, матывы з'яўляюцца структурнымі асаблівасцямі, а дамены - функцыянальныя вобласці пратэіна.


адказ 2:

Матыў вызначаецца як супер-другасная структура ў бялку. Яны могуць быць такімі ж маленькімі, як трыпептыд, простая аміналагічная паслядоўнасць, якая ў першую чаргу ўдзельнічае ў функцыянальнай ролі бялку. Прыкладамі з'яўляюцца грэчаскі ключавы матыў, матыў цынкавага пальца, амега-лук і г.д.

Дамены структурна вялікія адзінкі і ўтрымліваюць чацвярцічную структуру бялку. Гэта незалежна складзеныя бялковыя адзінкі, якія можна адрозніць як структурна, так і функцыянальна. Звычайна гэта паўтараюцца адзінкі ў вялікіх бялках. Прыклады ўключаюць бэта-барэль, дамен PDZ, зморшчыну глабіну, знойдзены галоўным чынам у імунаглабулінах, кадгерыны, якія паўтараюцца ў вавёрках залежнасці ад кальцыя.


адказ 3:

Матыў бялку - суперардынатная структура, якая ўтрымлівае некалькі другасных структур у ўстойлівым размяшчэнні і звычайна сустракаецца ў іншых вавёрках, якія не абавязкова маюць падабенства ў функцыі.

Напрыклад: пятля амега - гэта бялковы матыў з любой амінакіслотнай паслядоўнасцю, з адзінай умовай, каб яна ўтварыла ўстойлівую структуру, якая нагадвае грэчаскую літару амега. Гэта робіць матыў надзвычай распаўсюджаным, але нічога не скажаш пра яго значэнне для функцыі бялку.

У адрозненне ад гэтага, дамен бялку ўяўляе сабой стабільную структуру з пэўнай, спецыфічнай функцыяй у бялку і можа існаваць незалежна ад бялку, гэта значыць ён можа захоўваць сваю структуру, нават калі ён аддзелены ад бялку.

Прыклад: дамены SH2 (src homology 2) размешчаны ў сігнальных шляхах на шляху JAK-STAT, якія адказваюць за кантроль транскрыпцыі пэўных генаў. Функцыя гэтага дамена заключаецца ў прывязцы бялку, які змяшчае гэты дамен, да пэўных участкаў мембраннага бялку.